Die Stiftung Bayerische Gedenkstätten wurde 2003 mit der Trägerschaft der KZ-Gedenkstätten Dachau und Flossenbürg beauftragt. Seitdem ist sie dafür zuständig, die Gedenkstätten als authentische Orte zu erhalten und damit als steinerne Zeugen für die Verbrechen des Nationalsozialismus, als Orte der Erinnerung an die Leiden der Opfer sowie als Lernorte für künftige Generationen zu gestalten. Die Gedenkstätten sind zentraler Inhalt und Fokus der erinnerungskulturellen Landschaft in Bayern. Seit 2013 verantwortet die Stiftung zudem 75 KZ-Friedhöfe, die bayernweitverteilt sind.